Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms