Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF3Q9NR81 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms