Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4Q9NQC3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms