Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEPEQ9NQ76 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms