Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms