Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBN1Q9NPG3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBN1Q9NPG3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms