Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP2Q9NPB3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms