Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms