Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms