Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms