Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms