Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEBOXQ9HB31 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms