Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms