Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROPN1Q9HAT0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROPN1Q9HAT0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROPN1Q9HAT0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms