Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms