Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF41Q9H4P4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms