Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms