Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms