Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SENP6Q9GZR1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP6Q9GZR1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms