Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms