Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPO4Q9C0E2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPO4Q9C0E2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms