Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM8Q9BZR9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms