Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms