Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BARHL1Q9BZE3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BARHL1Q9BZE3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms