Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms