Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM54Q9BYV2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms