Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms