Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms