Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms