Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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