Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIGD2AQ9BW72 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms