Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms