Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYD88Q99836 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms