Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms