Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS8Q99627 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms