Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCLRE1CQ96SD1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms