Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms