Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms