Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A9Q96Q91 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms