Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms