Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms