Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms