Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFAP53Q96M91 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFAP53Q96M91 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP53Q96M91 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP53Q96M91 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms