Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms