Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRIQ1Q96JM4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
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