Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG3Q96JB2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG3Q96JB2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms