Protein–RNA interactions for Protein: Q96FA7

ZBED6CL, ZBED6 C-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6CLQ96FA7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED6CLQ96FA7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms