Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMTM5Q96DZ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms