Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC39Q96DD0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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