Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms